Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms