Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM208BQ5VWN6 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms