Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL133351.4-201ENST00000604204 631 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RFPL3-AS1_1.1-201ENST00000617561 88 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 GAB3-202ENST00000369575 4718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TBC1D3P1-DHX40P1-201ENST00000587125 1841 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF322-207ENST00000607204 4737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LRRC49-203ENST00000443425 3085 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC01258-201ENST00000512517 2059 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AC007638.2-201ENST00000574716 1740 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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MKRN4PQ13434 LINC01133-203ENST00000635112 1996 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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MKRN4PQ13434 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ADAMTS12-203ENST00000504830 8774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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MKRN4PQ13434 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL354984.1-201ENST00000371169 1854 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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MKRN4PQ13434 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 KIF2B-201ENST00000268919 2313 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NNT-208ENST00000512996 4288 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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