Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPRMP28827 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPRMP28827 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPRMP28827 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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