Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms