Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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