Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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