Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SEMA3E-201ENST00000307792 6476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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