Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms