Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms