Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPN13Q12923 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPN13Q12923 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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