Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF254982.1-201ENST00000611755 311 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6511B1-201ENST00000612014 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.194-201ENST00000612213 283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAGE13-201ENST00000612958 530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL354751.3-201ENST00000618526 1027 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL935212.4-201ENST00000618569 232 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL1-201ENST00000618786 299 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CU633906.3-201ENST00000623377 741 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPN7-219ENST00000629151 437 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM40-205ENST00000307859 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF438-205ENST00000436087 3164 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP12-202ENST00000345770 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACVR2B-AS1-201ENST00000441531 2517 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000708.1-201ENST00000527818 3423 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 F11-203ENST00000403665 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGKA-201ENST00000331886 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAPK2-201ENST00000261891 2603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATAT1-201ENST00000318999 2611 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02072-201ENST00000441895 2645 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007365.3-202ENST00000417695 1722 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF143-204ENST00000396604 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HCK-208ENST00000534862 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HCK-211ENST00000639405 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDZPH1P-201ENST00000412514 1783 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms