Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SCYL3-203ENST00000367772 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC019330.1-201ENST00000637390 1692 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RBM22-201ENST00000199814 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC00298-201ENST00000426969 2236 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 EXOC7-220ENST00000607838 3353 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC003684.1-201ENST00000432442 1715 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OTUB2-201ENST00000203664 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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