Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KIF5A-201ENST00000286452 3527 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NLRP12-204ENST00000391773 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 COX17P1-201ENST00000378775 192 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL137793.1-201ENST00000433734 599 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC013480.1-201ENST00000451514 346 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SL144P-201ENST00000475761 295 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 COX5AP2-201ENST00000554418 394 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC013290.1-201ENST00000586960 537 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CACNB4-246ENST00000637309 7409 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CPT1B-207ENST00000457250 2217 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RCBTB2-202ENST00000430805 3179 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SLC24A3-202ENST00000613834 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TBC1D28-202ENST00000405044 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 OGDHL-201ENST00000374103 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MELK-209ENST00000541717 2363 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC021491.4-201ENST00000620769 2573 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC091173.1-201ENST00000505627 2750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SAR1B-201ENST00000402673 6682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PTGFR-201ENST00000370756 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CABYR-218ENST00000627314 1622 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 VSIG4-201ENST00000374737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 UTP15-202ENST00000508491 1828 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MAPK10-205ENST00000395160 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NAP1L3-201ENST00000373079 2639 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 THUMPD1-202ENST00000396083 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PKD1L2-202ENST00000337114 3427 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GDA-202ENST00000358399 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 COL6A3-204ENST00000392003 3464 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LILRB2-205ENST00000434421 2773 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF23-202ENST00000358700 2692 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GINS3-201ENST00000318129 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PABPC1P12-201ENST00000428454 2175 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SCNN1B-201ENST00000307331 2085 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PCDHGA1-202ENST00000517417 4604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 COL14A1-202ENST00000297848 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NCR2-202ENST00000373086 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PAX4-203ENST00000378740 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ASS1P5-201ENST00000435496 1239 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 IGKV1D-17-201ENST00000483379 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 691 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SL457P-201ENST00000578760 287 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC008392.1-201ENST00000600941 437 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LINC02018-202ENST00000608707 445 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC007326.3-201ENST00000636418 176 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PSEN1-204ENST00000394164 3046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF568-202ENST00000415168 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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