Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FAN1-203ENST00000561607 2690 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DHX40-201ENST00000251241 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GNL3L-201ENST00000336470 2357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STIP1P3-201ENST00000394563 1624 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL050303.4-201ENST00000624520 1839 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGEF1B-201ENST00000264400 2277 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GP2-203ENST00000381360 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP2R2B-205ENST00000394414 2262 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARL1-201ENST00000261636 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CD79B-202ENST00000349817 378 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNA5SP244-201ENST00000390936 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OR13E1P-201ENST00000417104 922 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MT1XP1-201ENST00000421314 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FRG2FP-203ENST00000422555 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KRT18P12-201ENST00000425245 1273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms