Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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BNIP1Q12981 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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BNIP1Q12981 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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BNIP1Q12981 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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BNIP1Q12981 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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BNIP1Q12981 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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BNIP1Q12981 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BNIP1Q12981 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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