Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms