Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP17L18D6R9N7 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms