Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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COPS7AQ9UBW8 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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COPS7AQ9UBW8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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COPS7AQ9UBW8 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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COPS7AQ9UBW8 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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COPS7AQ9UBW8 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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COPS7AQ9UBW8 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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