Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms