Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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BCL11BQ9C0K0 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BCL11BQ9C0K0 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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