Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms