Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms