Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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