Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AP000350.7-201ENST00000624923 8030 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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LAMA3Q16787 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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