Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USF2Q15853 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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