Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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