Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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