Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TTC30B-201ENST00000408939 4017 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ADAM2-203ENST00000379853 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 C17orf102-201ENST00000623254 3997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF169-201ENST00000340911 2336 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AP001094.2-201ENST00000578897 2315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 NREP-205ENST00000446294 2065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ALOXE3-203ENST00000448843 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PHC1-201ENST00000433083 5033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HAVCR1-201ENST00000339252 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CCDC81-204ENST00000528728 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GOLGA6A-201ENST00000290438 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BOLL-202ENST00000321801 3135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC100827.4-201ENST00000563464 2441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CLDN18-201ENST00000183605 3520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CD2BP2-201ENST00000305596 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 DCTN3-204ENST00000378913 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL451074.1-201ENST00000400982 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL353133.2-201ENST00000402173 411 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SNAPC5P1-201ENST00000403621 301 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 KRT18P49-201ENST00000427083 832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL606468.1-201ENST00000444750 510 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RN7SL526P-201ENST00000469492 319 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC011894.1-201ENST00000603255 456 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL356458.1-201ENST00000604764 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC015849.1-201ENST00000605548 662 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SRGAP2D-201ENST00000605551 1021 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 NANOGP8-202ENST00000629403 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 INTS6-215ENST00000490542 2307 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC104051.2-201ENST00000518934 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TRIM51-202ENST00000449290 1629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF526-201ENST00000301215 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PIEZO1P2-201ENST00000416241 2180 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZBTB14-201ENST00000357006 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TREML4-201ENST00000341495 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ADAMTSL3-201ENST00000286744 7336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TRIM9-203ENST00000360392 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 NPAP1P4-201ENST00000443325 3310 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AMBN-201ENST00000322937 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SERPINA10-203ENST00000554173 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC098679.3-201ENST00000512016 3115 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TCF4-240ENST00000568673 2398 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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