Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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