Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NVL-212ENST00000469968 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TRIM35Q9UPQ4 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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TRIM35Q9UPQ4 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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