Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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FOXQ1Q9C009 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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FOXQ1Q9C009 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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FOXQ1Q9C009 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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FOXQ1Q9C009 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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