Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms