Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ANKS1B-205ENST00000546568 1281 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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