Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CECR3-201ENST00000428828 1915 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF385B-203ENST00000409692 2109 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR5L-216ENST00000530639 2291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC2-204ENST00000412522 3033 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNE4-201ENST00000281830 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS4B-201ENST00000238497 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138889.1-202ENST00000451317 3630 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MINOS1-210ENST00000617872 3678 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A2-201ENST00000366952 3737 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms