Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SS18Q15532 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SS18Q15532 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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