Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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