Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRZ1P23471 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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