Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms