Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AUP1Q9Y679 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AUP1Q9Y679 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AUP1Q9Y679 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms