Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYVE1Q9Y5Y7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms