Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms