Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms