Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP11Q9Y3A2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms