Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms