Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms