Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms