Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms