Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNMA8BQ9ULN7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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