Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms